Центр Высокопроизводительных вычислений СФУ

 

Центр обслуживает научные коллективы СФУ, взаимодействует с наукоемкими предприятиями Сибири, отделениями РАН, университетами России и Европы.

В составе центра 3 высокопроизводительных системы, объединяющих 280 счетных вычислительных серверов ( в составе комплексов  -сервера-лезвия IBM HS21 XM Xeon Quad core E5450 3.0 GHz, диск 74Gb, ОЗУ IBM 16 Gb (2x8Gb)и IBM HS21 XM Xeon Quad core 2.4 GHz, диск 74Gb, ОЗУ IBM 16 Gb (2x8Gb), управляющие сервера IBM x3650, 96 ядерный SMP сервер IBM x3950 X6 с объемом ОЗУ 3 ТБ, сервер IBM dx360 M4 c двумя GPU NVIDIA Tesla K20, платформа NextIO c 4 GPU NVIDIA M2090, системы хранения IBM DS3400, IBM DS4700, IBM Storwize V3700 ), SAN-сеть 8 Гбит/c, InfiniBand 20 Гбит/c.

Установлены программные комплексы позволяющие проводить ресурсоемкие расчеты в различных областях науки. Среди установленного ПО - ANSYS, Matlab, GAMESS-US, CFOUR, MRCC, NWChem, ORCA, AMBER 11, SigmaFlow., ПО геномных иссследований -  ABySS, FastQC, MaSuRCA. Все программное обеспечение имеет академические лицензии или является продуктами с открытым кодом.

Для предоставления удаленного доступа к высокопроизводительным ресурсам, СФУ имеет в своем распоряжении оптоволоконные каналы связи, обеспечивающие передачу информации со скоростью до 10 Гбит/сек и канал доступа в общие сети Internet со скоростью 500 Мбит/сек.

С 2010 года СФУ является членом Суперкомпьютерного консорциума университетов России, а с 2011 года членом Национальной технологической суперкомпьютерной платформы.

Участие СФУ в «Суперкомпьютерном консорциуме университетов России» позволило повысить качество подготовки специалистов по суперкомпьютерным технологиям. СФУ третий год участвует в Российской программе по обучению суперкомпьютерным технологиям в рамках Научно-образовательного центра по суперкомпьютерным технологиям - НОЦ СКТ «Сибирь». Разработаны совместные курсы «Введение в суперкомпьютерные технологии», «Параллельные вычисления на кластерах». Проведена переподготовка преподавателей по данным направлениям и обучение магистров ИКИТ, Института математики, Института цветных металлов и материаловедения СФУ.

За период с 2010 г. – 2014 г. пользователями центра выпущено более 150 публикаций в которых отражены результаты, полученные с использованием суперкомпьютера СФУ (все публикации содержат ссылку на суперкомпьютер СФУ), по результатам полученных с использованием суперкомпьютера защищено 19 диссертаций, из них 4 докторские. Среди задач обслуживаемых комплексом: фундаментальные исследования ученых СФУ и СибГАУ, работы по моделированию динамики лесных пожаров СФУ и СИБГТУ, совместные проекты СФУ (кафедра физической и неорганической химии) и Института химии высокочистых веществ им Г.Г. Девятых РАН, г. Нижний Новгород, совместные проекты научной группы Института математики СФУ в сотрудничестве с Институтом вычислительного моделирования СО РАН; ГИС СФУ. Проекты: СФУ и Института физики СО РАН, Центра коллективного пользования СФУ, кафедры теоретической физики и волновых явлений ИИФиРЭ СФУ, Института архитектуры и дизайна, института цветных металлов и материаловедения СФУ, кафедры теплофизики, кафедры биофизики ИФБиБТ, лаборатории биолюминесцентных биотехнологий СФУ, кафедры «Динамика и прочность машин» СФУ, Лимонологического института СО РАН г. Иркутск, Института химии и химической технологии СО РАН (Группа квантовой химии лаборатории спектроскопии и анализа) и др.

Сотрудники центра специализируются в области организации управления высокопроизводительными комплексами. Силами центра реализуется проект «Высокопроизводительные вычисления как сервис». Проект обеспечивает создание универсальной инфраструктуры обработки данных, в которой функционирует множество сервисов, решающих конкретные прикладные задачи. Доступ пользователей к распределенным ресурсам центра осуществляется через единый Web-портал. Реализована комплексная система управления, позволяющая администраторам эффективно управлять вычислительными ресурсами, вводить новое специализированное ПО, осуществлять мониторинг ресурсов и задач пользователей. 

 

Концепция развития Центра высокопроизводительных вычислений СФУ

 

Концепцией развития Центра высокопроизводительных вычислений СФУ в рамках региональной платформы является адресное посегментное развитие высокопроизводительных ресурсов, каждый из которых решает свой класс задач. Для эффективности использования, созданные сегменты предполагается объединять в единую систему управления ресурсами, что позволит считать разноплановые научно-практические проекты коллективов СФУ, организаций-партнеров и сторонних заказчиков. 

Каждый такой создаваемый сегмент должен будет обладать уникальными характеристиками, обеспечивающих уникальное преимущество СФУ в регионе по возможности решения соответствующих классов задач.  

Для предоставление доступа к высокопроизводительным ресурсам СФУ создается универсальная инфраструктура обработки данных, в которой функционирует множество сервисов, решающих конкретные прикладные и научные задачи. 

В рамках участия СФУ в региональной платформе «Информационно-телекоммуникационные и космические технологии для инновационного развития Сибири»

Проведена апробация свободного программного обеспечения для реализации облачных и Grid сервисов на базе высокопроизводительных ресурсов СФУ. 

Развернута Grid-инфраструктура на базе высокопроизводительных ресурсов Сибирского Федерального Университета, как основы для создания специализированных высокопроизводительных сервисов.  

Внедрены современные средства доступа к высокопроизводительным ресурсам.

Реализована комплексная система управления, позволяющая администраторам эффективно управлять вычислительными ресурсами, вводить новое специализированное ПО, осуществлять мониторинг ресурсов и задач пользователей. 

Создание Grid-инфраструктуры открывает возможности для включения в него различных прикладных и научных сервисов.

 

Международное сотрудничество

 

С 2013 г. Сотрудничество с Центром по биоинформатике им. Таубера, университет г. Хайфы (Израиль).

2013 г. Подписан меморандум о сотрудничестве между университетом г. Хайфы и СФУ.

2014 г. Подписано Соглашение о совместном ведении диссертации между Кафедрой эволюционной и экологической биологии университета г. Хайфы и СФУ.

 

СМИ о нашем комплексе

 

ОАО «Красноярское информационное телевидение (ТВК - 6 канал)» Что может суперкомпьютер СФУ? http://tvk6.ru/video/3869

Популярный видеоматериал о возможностях суперкомпьютерного комплекса СФУ представлен в программе «Новое утро на ТВК» 28.09.2012 г. автор Юрий Пушкарев

Суперкомпьютерный дайджест 2010-2012

Летний выпуск журнала "Суперкомпьютеры" 2012 г.