Сотрудники центра специализируются в области организации управления высокопроизводительными комплексами, созданием специализированных Web-сервисов. Силами центра реализуется проект «Высокопроизводительные вычисления как сервис». Проект обеспечивает создание универсальной инфраструктуры обработки данных, в которой функционирует множество сервисов, решающих конкретные прикладные задачи. Доступ пользователей к распределенным ресурсам центра осуществляется через единый Web-портал. Реализована комплексная система управления, позволяющая администраторам эффективно управлять вычислительными ресурсами, вводить новое специализированное ПО, осуществлять мониторинг ресурсов и задач пользователей. 

На базе центра реализован сервис 3D-рендеринга ориентированный на широкий круг пользователей работающих с 3D-графикой - дизайнеров, аниматоров, архитекторов. Система поддерживает загрузку проектов выполненных в пакетах 3DMax, Maya, Cinema4D. Рендеринг проектов выполняется в автоматическом режиме на распределенных суперкомпьютерных ресурсах центра с использованием ПО  MentalRay и V-Ray.

По предварительной договоренности кафедры высокопроизводительных вычислений и центра Тауберга университета Хайфы (Израиль) разрабатывается, совместными силами, научно-исследовательский и образовательный биоинформационный сервис, аккумулирующий разрабатываемые методики анализа данных, уже известные пакеты обработки данных и алгоритмы, разрабатываемые исследовательской группой центра Тауберга. Одной из особенностью сервиса является возможность подключение различных суперкомпьютерных ресурсов, на которых будут установлены специализированные пакеты анализа данных. Этот сервис позволит исследователям в едином интерфейсе проводить анализ данных с использованием специализированных пакетов и алгоритмов, собранных в сервисе, и подключать различные суперкомпьютерные ресурсы. 

Наши сотрудники оказывают поддержку вычислительных ресурсов Центра геномных исследований СФУ.

Еще одной специализацией сотрудников центра Высокопроизводительных вычислений СФУ является создание эффективных параллельных программ для различных параллельных архитектур. Сотрудники специализируются на программировании графических процессоров и архитектуре CUDA, технологиях параллельного программирования от Intel. 

Центр активно сотрудничает с научными группами СФУ, так в сотрудничестве с научной группой профессора Черемисина А.А. создан программный комплекс «Фотофорез и динамика аэрозоля», включающий в себя набор параллельных программ написанных с использованием технологии CUDA для ускорения расчетов на графических ускорителях Nvidia Tesla. Разработка получила диплом X специализированного форума-выставки «itCOM – Информационные технологии. Телекоммуникации» 17-19 октября 2012 г. 

Кузьмин Дмитрий Александрович

Кузьмин Дмитрий Александрович

к.т.н., доцент, заведующий кафедрой "Высокопроизводительные вычисления".

С 2007 г. ведет работу по созданию Центра высокопроизводительных вычислений СФУ, формированию высококвалифицированной команды. Разрабатывал концепцию системы управления суперкопьютерным комплексом. Занимался созданием и внедрением эффективной системы управления и мониторингом суперкомпьютерного комплекса.

Руководитель магистерского профиля 230100.68.01 «Высокопроизводительные вычислительные системы» по направлению «Информатика и вычислительная техника»

Членство в ГЭК, ГАК по направлению «Информатика и вычислительная техника» и «Прикладная математика»

Представитель СФУ в Суперкомпьютерном консорциуме университетов России.

Стажировался в центре высокопроизводительных вычислений CYFRONET (Academic Computer Centre CYFRONET of the University of Science and Technology ) Польша с 05.11.08 – 20.11.08;

2011–2012 гг. участие в международном проекте 159386-TEMPUS-1-2009-1-DE-TEMPUS-JPCR Modernization of Master Program NETWORKS & COMMUNICATIONS (исполнитель)

C 2014 г. участие в мега-проекте «Геномные исследования основных бореальных лесообразующих хвойных видов и их наиболее опасных патогенов в Российской Федерации» (договор №14.Y26.31.0004) 

Маколов Степан Викторович

Маколов Степан Викторович

Выпускник ИКИТ СФУ 2010 г., закончил магистратуру по направлению 230100.68 - «Информатика и вычислительная техника», профиль 230100.68.05 «Сети ЭВМ и телекоммуникации».

Навыки: системное администрирование ОС Linux, Windows. Администрирование суперкомпьютерных систем. Сетевое администрирование (Cisco). Администрирование дисковых подсистем IBM. Системы управления суперкомпьютерами: IBM CSM, IBM xCat. Настройка систем мониторинга Rital SMC TC. Развертывание и настройка системы пакетной обработки и планировщики для суперкомпьютеров — Torque, Maui. Программирование Bash скриптов.

C 2009 года является сотрудником центра высокопроизводительных вычислений. Занимается системным администрированием комплекса высокопроизводительных вычислений СФУ. Принимал активное участие в проработке архитектуры системы управления комплексом. Занимался созданием и внедрением эффективной системы управления и мониторингом суперкомпьютерного комплекса.

Осуществляет системную поддержку всех направлений работ центра.

С 2014 г принимает активное участие в качестве исполнителя в мега-проекте «Геномные исследования основных бореальных лесообразующих хвойных видов и их наиболее опасных патогенов в Российской Федерации» (договор №14.Y26.31.0004). 

Авторские свидетельства:

Комплекс предобработки ридов NGS. №2017610541, дата регистрации 12.01.2017 г. Авторы: Шаров Вадим Витальевич, Маколов Степан Викторович, Кузьмин Дмитрий Александрович.

Программный комплекс по подготовке ридов NGS Illumina к ассемблированию Авторское свидетельство № 2015619381, 01.09.2015 Шаров В.В., Цыбин А.Н., Маколов С.В., Кузьмин Д.А. 

Программный комплекс для запуска и исполнения ресурсоемких заданий с использованием высокопроизводительных ресурсов Авторское свидетельство № 2014611936, 13.02.2014 Астриков Д.Ю., Кузьмин Д.А., Маколов С.В. 

Астриков Дмитрий Юрьевич

Астриков Дмитрий Юрьевич

Выпускник ИКИТ СФУ 2012 г., закончил магистратуру по направлению 230100.68 - «Информатика и вычислительная техника», профиль 230100.68.01 «Высокопроизводительные вычислительные системы». Диплом с отличием. Стипендия президента России - 2011 г.

Аспирант ИКИТ с 2012 г.

В проектах центра активно участвует с 2010 года.

Навыки:

Языки программирования и фреймворки - PHP (Yii framework), Python (Django), Javascript (jQuery, YUI, Backbone.js, Require.js). Базы данных - PostgreSQL, Oracle. Системы контроля версий: Git, Mercurial. Системы пакетной обработки и планировщики для суперкомпьютеров — Torque, Maui.

Основная специализация - Web-программист. Занимается созданием специализированных сервисов, обеспечивающих удобный доступ к суперкомпьютерным ресурсам и организацией системы эффективного распределения ресурсов в сервисе.

Создатель Web-портала комплекса http://cluster.sfu-kras.ru

Ведет несколько собственных проектов:

1.www.plumcmf.com- opensource проект, система управления сайтами на базе быстрого и гибкого Yii Framework и PostgreSQL.

2.www.projectorium.biz- система управления задачами и проектами для малых команд. (Django + PostgreSQL)

3.http://charm.astrikov.ru- сервис для совместной разработки интернет-проектов. Функционал: Agile, code review, обсуждение макетов дизайна, интеграция с репозиториями на BitBucket и Github

Авторские свидетельства:

Программный комплекс для запуска и исполнения ресурсоемких заданий с использованием высокопроизводительных ресурсов Авторское свидетельство № 2014611936, 13.02.2014 Астриков Д.Ю., Кузьмин Д.А., Маколов С.В.

Удалова Юлия Васильевна

Удалова Юлия Васильевна

Кандидат технических наук, доцент кафедры "Высокопроизводительные вычисления".

Тема диссертационной работы "Отладка и верификация функционально-потоковых параллельных программ"

Преподает учебные дисциплины "Параллельное программирование", "Теория и технология программирования", "Математические и алгоритмические основы объектно-ориентированного программирования". Дисциплина "Параллельное программирование" предполагает разработку многопоточных параллельных Pthread программ, многопроцессных распределенных параллельных MPI программ и параллельных CUDA программ для выполнения на графических ускорителях. 

Является автором девяти учебно-методических пособий. 

Исполнитель в научно-методическом проекте «Среда разработки для языка параллельного программирования Пифагор» в рамках «Программы развития СФУ на 2007–2010 годы».
Исполнитель в научно-методическом проекте «Инструментальная поддержка архитектурно-независимой разработки параллельных программ на основе функционально-потоковой парадигмы параллельного программирования»  в рамках федеральной целевой программы «Научные и научно-педагогические кадры инновационной России», выполнявшегося в 2012-2013 гг.

Черников Сергей Васильевич

Черников Сергей Васильевич

аспирант ИКИТ с 2014 г.

Диплом магистра по направлению 230100.68 - «Информатика и вычислительная техника», профиль 230100.68.01 «Высокопроизводительные вычислительные системы» с отличием, Стипендия президента — 2013-2014 г..

Диплом бакалавра по направлению «Информатика и вычислительная техника» с отличием. Стипендия президента — 2012 г.

Участие в проектах центра с 2011 г.

Основная специализация — параллельное программирование.

Участие в проекте разработки программного комплекса «Фотофорез и динамика аэрозоля», включающего в себя набор параллельных программ, написанных с использованием технологии CUDA для ускорения расчетов на графических ускорителях Nvidia Tesla.

Диплом X специализированного форума-выставки «itCOM – Информационные технологии. Телекоммуникации» 17-19 октября 2012 г. за проект - разработка программного комплекса «Фотофорез и динамика аэрозоля» в составе команды Черников С.В., Никитин В.Н.

Стипендиат Летней молодежной школы-стажировки Intel (июль – август 2013 года). Стажировка по технологиям параллельного программирования проходит в центре разработки программного обеспечения компании Intel – Новосибирск.

Никитин Вадим Николаевич

Никитин Вадим Николаевич

аспирант ИКИТ с 2014 г.

Диплом магистра по направлению 230100.68 - «Информатика и вычислительная техника», профиль 230100.68.01 «Высокопроизводительные вычислительные системы» с отличием, Стипендия президента — 2013-2014 г..

Диплом бакалавра по направлению «Информатика и вычислительная техника» с отличием. Стипендия президента — 2012 г.

Участие в проектах центра с 2011 г.

Основная специализация — параллельное программирование.

Участие в проекте разработки программного комплекса «Фотофорез и динамика аэрозоля», включающего в себя набор параллельных программ, написанных с использованием технологии CUDA для ускорения расчетов на графических ускорителях Nvidia Tesla.

Диплом X специализированного форума-выставки «itCOM – Информационные технологии. Телекоммуникации» 17-19 октября 2012 г. за проект - разработка программного комплекса «Фотофорез и динамика аэрозоля» в составе команды Черников С.В., Никитин В.Н.

Участие в проекте создания сервиса 3D-рендеринга rendermama.com.

Второе место на XX региональном смотре-конкурсе молодежных IT-проектов Soft-Парад 2013 за проект "Облачная Рендерферма" в составе группы Маколов С.В., Панасюк А.И., Никитин В.Н.

Шаров Вадим Витальевич

Шаров Вадим Витальевич

Аспирант, ассистент кафедры высокопроизводительных вычислений с 2016 г.

Участие в проектах центра с 2013 г.

В 2016 г. с отличием закончил магистратуру по направлению 230100.68 - «Информатика и вычислительная техника», профиль 230100.68.01 «Высокопроизводительные вычислительные системы».

Тема магистерской диссертации: Комплекс параллельной обработки данных, основанный на технологии CUDA.

Диплом специалиста 230105.65 "Программное обеспечение вычислительной техники и автоматизированных систем" 2014 г.

Тема дипломной работы: Исследование особенностей реализаций параллельных алгоритмов для гибридных вычислительных архитектур.

Работа прошла конкурсный отбор на участие во Всероссийском конкурсе прорывных проектов в области IT-технологий IT-Прорыв 2014-2015

Основная специализация — параллельное программирование.

2014 г. участие в мега-проекте «Геномные исследования основных бореальных лесообразующих хвойных видов и их наиболее опасных патогенов в Российской Федерации» (договор №14.Y26.31.0004) по Постановлению Правительства РФ № 220 от 9 апреля 2010 г. «О мерах по привлечению ведущих ученых в российские образовательные учреждения высшего профессионального образования». 

Авторские свидетельства:

1. Программный комплекс по подготовке ридов NGS Illumina к ассемблированию Авторское свидетельство № 2015619381, 01.09.2015 Шаров В.В., Цыбин А.Н., Маколов С.В., Кузьмин Д.А. 

2. Программный комплекс для определения размеров библиотек (insert size) парных ридов NGS Illumina Авторское свидетельство № 2015662065, 16.11.2015 Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна. Кузьмин Дмитрий Александрович

3. Программа индексирования геномных последовательностей большого размера методом «FM-index» на графических ускорителях. №2016663584, дата регистрации 13.12.2016 г. Авторы: Шаров Вадим Витальевич, Путинцева Юлия Андреевна, Кузьмин Дмитрий Александрович

4. Комплекс предобработки ридов NGS. №2017610541, дата регистрации 12.01.2017 г. Авторы: Шаров Вадим Витальевич, Маколов Степан Викторович, Кузьмин Дмитрий Александрович.

Значимые публикации:

1. М. М. Белоконь, Д. В. Политов, Е. А. Мудрик, Т. А. Полякова, А. В. Шатохина, Ю. С. Белоконь, Н. В. Орешкова, Ю. А. Путинцева, В. В. Шаров,Д. А. Кузьмин, К. В. Крутовский РАЗРАБОТКА МИКРОСАТЕЛЛИТНЫХ МАРКЕРОВ СОСНЫ КЕДРОВОЙ СИБИРСКОЙ (Pinus sibirica Du Tour) ПО РЕЗУЛЬТАТАМ ПОЛНОГЕНОМНОГО de novo СЕКВЕНИРОВАНИЯ //ГЕНЕТИКА, 2016, том 52, No 12, с. 1418–1427 (SCOPUS, импакт-фактор 0.448 http://vigg.ru/genetika/ )

2. А.Н. Цыбин, В.В. Шаров, Ю.А. Путинцева, С.И. Феранчук, Д.А. Кузьмин «Параллельный алгоритм фильтрации повторов в данных NGS ILLUMINA» Доклады Академии Наук ВШ РФ, 2016, no. 4 (33), pp. 99–110. doi: 10.17212/1727- 2769-2016-4-99-110

 

 

 

Панасюк Александр Иванович

Панасюк Александр Иванович

выпускник ИКИТ СФУ 2011 г., инженер-системотехник по специальности «Вычислительные комплексы, системы и сети», направление 230100.

С 2011 года аспирант ИКИТ, тема работы «Распределенная визуализация трехмерных моделей»

В проектах центра активно участвует с 2010 года.

Навыки: ОС Linux, Windows. Языки программирования: Ruby (Ruby on Rails), Javascript (jQuery), Bash (Linux), MaxScript. СУБД — PostgreSQL. Системы пакетной обработки и планировщики для суперкомпьютеров — Torque, Maui.

Основная специализация - системный программист, Web-программист. Занимается созданием специализированных сервисов, обеспечивающих удобный доступ к суперкомпьютерным ресурсам и организацией системы эффективного распределения ресурсов в сервисе.

Разработчик ядра сервиса 3D-рендеринга.

Участвует в создании научно-исследовательского и образовательного биоинформационного сервиса.

Цыбин Александр Николаевич

Цыбин Александр Николаевич

Магистр 2-го курса по направлению 230100.62 - "Информатика и вычислительная техника". профиль "Высокопроизводительные вычислительные системы"

Обладает навыками программирования на языках C++, PythonJava,Javascript. Имеет опыт работы с QtAndroid.

Интересы: параллельное программирование с применением таких технологий, как MPIopenmpCUDA и стандарта C++11.

C 2014 г. участие в мега-проекте «Геномные исследования основных бореальных лесообразующих хвойных видов и их наиболее опасных патогенов в Российской Федерации» (договор №14.Y26.31.0004) по Постановлению Правительства РФ № 220 от 9 апреля 2010 г. «О мерах по привлечению ведущих ученых в российские образовательные учреждения высшего профессионального образования». 

Авторские свидетельства

Программный комплекс фильтрации повторяющихся последовательностей (рипитов) в ридах NGS Illumina Авторское свидетельство № 2015619173, 26.08.2015 Цыбин А.Н., Кузьмин Д.А., Феранчук С.И., Путинцева Ю.А.

Значимые публикации:

А.Н. Цыбин, В.В. Шаров, Ю.А. Путинцева, С.И. Феранчук, Д.А. Кузьмин «Параллельный алгоритм фильтрации повторов в данных NGS ILLUMINA» Доклады Академии Наук ВШ РФ, 2016, no. 4 (33), pp. 99–110. doi: 10.17212/1727- 2769-2016-4-99-110